Studi Docking Molekuler Senyawa [(5-prop-2-enylpyrimidin-2-yl) propanoate] dan [4-((1e)-buta-1,3-dienyl)phenol] Terhadap Protein Er-Α, Er-Β, dan IKK sebagai Agen Sitotoksik
DOI:
https://doi.org/10.32583/far.v13i3.2316Keywords:
ACA, adverse drug reaction, ER-α, ER-β, IKK, kanker payudaraAbstract
Kanker merupakan salah satu penyebab kematian yang tergolong penyakit tidak menular dan kasusnya terus bertambah. Kanker payudara sering ditemukan pada wanita di seluruh dunia. 1’-Acetoxychavicol acetate (ACA) adalah fenilpropanoid dalam rimpang spesies jahe Alpinia. ACA menunjukkan aktivitas sitotoksik pada berbagai lini sel tumor, salah satunya MCF7 (sel kanker payudara) dengan nilai IC50 berkisar antara 5 - 50 μM tanpa toksisitas terhadap sel normal. Tujuan dilakukan penelitian ini adalah mengetahui senyawa turunan ACA memiliki aktivitas antikanker terhadap protein kanker payudara secara in silico dengan docking molekuler. Protein target yang digunakan adalah ER-α, ER-β, dan IKK. Senyawa uji yang digunakan adalah senyawa 1 [(5-prop-2-enylpyrimidin-2-yl) propanoate], senyawa 2 [4-((1e)-buta-1,3-dienyl)phenol], lalu terdapat tambahan doksorubisin (sebagai kontrol positif), dan metformin (sebagai kontrol negatif). Parameter docking berupa nilai afinitas, semakin kuat ikatan ligan terhadap reseptor, maka semakin baik prediksi docking molekuler dinyatakan dengan nilai afinitas ikatan yang semakin kecil. Parameter lain yaitu nilai Root Mean Square Deviation (RMSD). Pengujian dinyatakan valid ketika hasil RMSD ≤ 2 Å. Dilakukan visualisasi juga yang menghasilkan interaksi antara residu asam amino dengan ligan. Hasil nilai afinitas senyawa 1 dengan protein ER-α, ER-β, dan IKK berturut-turut -6.3 kkal/mol, -6.2 kkal/mol, dan -5.8 kkal/mol. Pada senyawa 2 berturut-turut -5.7 kkal/mol, -6.2 kkal/mol, dan -6.8 kkal/mol. Hasil RMSD senyawa 1 berturut-turut 0.587 Å, 1.15 Å, 1.047 Å dan senyawa 2 berturut-turut 0.177 Å, 1.146 Å, 1.295 Å. Hasil visualisasi pada senyawa 1 dan senyawa 2 menunjukkan kemiripan dengan doksorubisin (kontrol positif). Hasil tersebut menandakan senyawa 1 [(5-prop-2-enylpyrimidin-2-yl) propanoate] dan senyawa 2 [4-((1e)-buta-1,3-dienyl)phenol] berpotensi sebagai agen antikanker payudara.
References
Ali Abdalla, Y. O., Subramaniam, B., Nyamathulla, S., Shamsuddin, N., Arshad, N. M., Mun, K. S., Awang, K., & Nagoor, N. H. (2022). Natural Products for Cancer Therapy: A Review of Their Mechanism of Actions and Toxicity in the Past Decade. Journal of Tropical Medicine, 2022. https://doi.org/10.1155/2022/5794350
Awasthee, N., Rai, V., Chava, S., Nallasamy, P., Ajaikumar, B., Bishayee, A., Chauhan, S. C., Challagundla, K. B., Gupta, S. C., Pradesh, U., & Buffett, P. (2020). Targeting IkappaB Kinases for Cancer Therapy. Semin Cancer Biol, 12–24. https://doi.org/10.1016/j.semcancer.2018.02.007.Targeting
Božović, A., Mandušić, V., Todorović, L., & Krajnović, M. (2021). Estrogen receptor beta: The promising biomarker and potential target in metastases. International Journal of Molecular Sciences, 22(4), 1–24. https://doi.org/10.3390/ijms22041656
Da’i, M., Meilinasary, K. A., Suhendi, A., & Haryanti, S. (2019). Selectivity Index of Alpinia galanga Extract and 1’-Acetoxychavicol Acetate on Cancer Cell Lines. Indonesian Journal of Cancer Chemoprevention, 10(2), 95. https://doi.org/10.14499/indonesianjcanchemoprev10iss2pp95-100
Fadlan, A., Warsito, T., & Sarmoko, S. (2022). Mengungkap Aktivitas Antikanker Senyawa Dihidrokaempferida secara In Silico. Jambura Journal of Chemistry, 4(1), 39–48. https://doi.org/10.34312/jambchem.v4i1.11512
Hasan, O. R., Cholashotul I’anah, F., Resvita, R., & Bahi, R. (2022). DOCKING MOLEKULER SENYAWA POTENSIAL DAUN KELOR (Moringa oleifera) TERHADAP RESEPTOR FOLAT. Journal of Innovation Research and Knowledge, 2(2), 519–526.
Hero, S. K. (2021). Faktor Resiko Kanker Payudara. Jurnal Medika Hutama, 03(01), 1533–1538.
Jenie, R. I., Santoso, R. A., Salsabila, I. A., Nugraheni, N., & Meiyanto, E. (2021). Alpinia galanga extract induces senescence in human epidermal growth factor receptor 2-overexpressing breast cancer cells. Thai Journal of Pharmaceutical Sciences, 45(1), 1–7.
Jufri, Q. S., & Azra, F. (2023). Pemodelan Hubungan Muatan Atom Bersih dengan Aktivitas Senyawa Turunan Metronidazol Ariloksi sebagai Antikanker Payudara dengan Metode AM1. Periodic, 12(2), 63–70. https://doi.org/10.24036/periodic.v12i2.117621
Kai, Q. X. A., Rumengan, I. F., Lintang, R. A., Wullur, S., Sumilat, D. A., Pangkey, H., & Luntungan, H. A. (2021). Penambatan Molekul Glutation Fauna Laut Terhadap Reseptor Dari Beberapa Penyakit Virus. Jurnal Pesisir Dan Laut Tropis, 9(2), 53–58. https://doi.org/10.35800/jplt.9.2.2021.34853
Manzano, J. A. H., Laurence, C., Iii, M. C., & G, A. P. (2022). Molecular docking studies of Alpinia galanga metabolites against human placental aromatase for estrogen-dependent breast cancer treatment. Laboratory for Organic Reactivity, Discovery, and Synthesis (LORDS), 1–7.
Muttaqin, F. Z. (2019). Molecular Docking and Molecular Dynamic Studies of Stilbene Derivative Compounds As Sirtuin-3 (Sirt3) Histone Deacetylase Inhibitor on Melanoma Skin Cancer and Their Toxicities Prediction. Journal of Pharmacopolium, 2(2), 112–121. https://doi.org/10.36465/jop.v2i2.489
Naufa, F., Mutiah, R., Yen, Y., & Indrawijaya, A. (2022). Studi in Silico Potensi Senyawa Katekin Teh Hijau (Camellia sinensis) sebagai Antivirus SARS CoV-2 terhadap Spike Glycoprotein (6LZG) dan Main Protease (5R7Y). J.Food Pharm.Sci, 10(1), 584–596.
Nuraini, M., & Ruswanto. (2021). Studi In Silico Senyawa Galangin Lengkuas ( Alpinia galanga ) Sebagai Antikanker Terhadap Kanker Payudara. 178–191.
Pagano, M. T., Ortona, E., & Dupuis, M. L. (2020). A Role for Estrogen Receptor alpha36 in Cancer Progression. Frontiers in Endocrinology, 11(July), 1–7. https://doi.org/10.3389/fendo.2020.00506
Pitaloka, A. D., Nurhijriah, C. Y., Musyaffa, H. A., & Azzahra, A. M. (2023). Molecular Docking of Chemical Constituents of Dayak Onion (Eleutherine palmifolia (L.) Merr) towards VHR Receptors as Candidates for Cervical Anticancer Drugs. Indonesian Journal of Biological Pharmacy, 3(2), 83–95.
Pradubyat, N. (2019). The effect of 1’acetoxychavicol acetate on cell proliferation , metastasis , and angiogenesis in human endocrine-resistant breast cancer cells The effect of 1 ’ acetoxychavicol acetate on cell proliferation , metastasis , and an. In Chula Digital Collections.
Pratama, P. R., Isman, F., & Fadlan, A. (2022). Penyelidikan Aktivitas Antikanker Payudara oleh Minyak Atsiri Bunga Michelia Alba Secara In Silico. Al-Kimiya: Jurnal Ilmu Kimia Dan Terapan, 9(1), 1–9. https://doi.org/10.15575/ak.v9i1.17380
Souza, P. F. N., Lopes, F. E. S., Amaral, J. L., Freitas, C. D. T., & Oliveira, J. T. A. (2020). A molecular docking study revealed that synthetic peptides induced conformational changes in the structure of SARS-CoV-2 spike glycoprotein, disrupting the interaction with human ACE2 receptor. International Journal of Biological Macromolecules, 164, 66–76. https://doi.org/10.1016/j.ijbiomac.2020.07.174
Suhendi, A., Wikantyasning, E. R., Setyadi, G., Wahyuni, A. S., & Da’i, M. (2017). Acetoxy Chavicol Acetate (ACA) Concentration and Cytotoxic Activity of Alpinia galanga Extract on HeLa, MCF7 and T47D Cancer Cell Lines. Indonesian Journal of Cancer Chemoprevention, 8(2), 81. https://doi.org/10.14499/indonesianjcanchemoprev8iss2pp81-84
Sururi, A. M., Maharani, D. K., & Wati, F. A. (2023). Potensi Senyawa Eugenol Dari Cengkeh (Syzygium Aromaticum) Sebagai Inhibitor Protease HIV-1 (PR). Unesa Journal of Chemistry, 12(1), 26–30. https://doi.org/10.26740/ujc.v12n1.p26-30
Wulan, & Yuliana, D. (2024). Literature Review : Perkembangan Pengobatan Kemoterapi Kanker Payudara. Makassar Pharmaceutical Science Journal, 2(1), 32–40.
Downloads
Published
How to Cite
Issue
Section
License
Copyright (c) 2024 Fathan Taqwim Hindami, Muhammad Da’i, Ahmad Fauzi, Febri Wulandari
This work is licensed under a Creative Commons Attribution-NonCommercial-NoDerivatives 4.0 International License.
